É desde 1993 director de enologia na Aliança Vinhos de Portugal e reponsável pelos vinhos das regiões dos Vinhos Verdes, Douro, Beira Interior, Dão e Bairrada, assim como dos vinhos espumantes e das aguardentes. Na sua longa carreira desenvolveu vários trabalhos de investigação e foi-lhe atribuido o prémio de Melhor Enólogo, em 2006, pela Essência do Vinho e em 2023 Enólogo do Ano pela revista Grandes Escolhas. Francisco Antunes é licenciado pela Universidade de Évora em Engenharia Agrícola, e diplomado em Enologia pelo Instituto de Enologia de Bordéus.
